液质联用氮气发生器的工作原理是分离空气，电解膜的负极侧发生氧化反应，吃掉空气中的氧化性气体，在正极侧还原，空气流过电解池后就只剩下氮气和惰性气体，故国内发生器的纯度大多标有“相对含氧量”，氮气的纯度和空气流速，有效分解面的长度，电解电势的强弱都有关系，这种分离方法也决定了氮气的纯度不可能做的很高。加入电解质的作用就是提高水的导电率，使电化学反应能顺利进行。
液质联用氮气发生器的氮气主要供给离子源，主要是帮助脱溶剂。有些可以开一道反吹气、吹扫气、帘气什么的抗污染的气。但是：其实做灵敏度测试指标时，大家又倾向于用更稳定的氮气流。当然是气瓶，然后是液氮罐、zui后才是发生器。
液质联用氮气发生器的工作原理是通过空气压缩机将外界的空气收集到储气罐中，再将空气通入电解分离池，氮气和氧气在电解池内产生分离。氧气被释放到大气中，氮气经过净化、干燥后输出。仪器通过系统压力可以自动调节氮气输出量，并迅速稳定。
值得提醒的一点是：液质联用氮气发生器只能在实验室内或实验室外很近的位置采集空气作为气源，而实验室内空气经常是受到污染的，其中的有机溶剂含量因为实验前处理过程等原因不可避免的超标。
液质联用氮气发生器的标称纯度也不过98%，和钢瓶氮气的纯度没法比。所以氮气发生器尤其是国产的在色谱实验中是个鸡肋型的产品，其纯度无法达到GC分析的要求。
